More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2842 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  354  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  79.33 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  77.65 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  74.86 
 
 		 179 aa  267  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  69.83 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  72.07 
 
 		 179 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  64.25 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 179 aa  200  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  55.62 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 180 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  54.75 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  188  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  184  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  55.81 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  53.51 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  50.29 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  53.22 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>