294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2839 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  72.88 
 
 		 59 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  64.41 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  64.41 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  61.02 
 
 		 59 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  52.73 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0678  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  52.63 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  50.98 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  47.37 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1244  50S ribosomal protein L30P  40.35 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186097  hitchhiker  0.00279952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>