More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2823 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  100 
 
 
329 aa  650  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  73.7 
 
 
335 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  64.29 
 
 
328 aa  338  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.43256e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  53.31 
 
 
329 aa  328  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  53.44 
 
 
333 aa  305  9e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  53.29 
 
 
333 aa  303  3e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  52.13 
 
 
335 aa  298  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  51.85 
 
 
355 aa  289  5e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  44.95 
 
 
335 aa  268  9e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  41.99 
 
 
330 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  39.08 
 
 
344 aa  197  2e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  34.97 
 
 
395 aa  190  3e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 
328 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  34.06 
 
 
328 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  34.06 
 
 
328 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  36.34 
 
 
359 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  37.42 
 
 
345 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  37.42 
 
 
345 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  35.15 
 
 
331 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  38.75 
 
 
340 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  36.79 
 
 
332 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  39.09 
 
 
334 aa  174  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  39.93 
 
 
354 aa  174  2e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  34.57 
 
 
348 aa  174  2e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  36.62 
 
 
350 aa  172  7e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  38.23 
 
 
320 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  38.75 
 
 
344 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  34.74 
 
 
368 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  33.1 
 
 
328 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  37.76 
 
 
344 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  35.85 
 
 
339 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  34.87 
 
 
331 aa  166  7e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  36.81 
 
 
343 aa  164  2e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  35.58 
 
 
331 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  36 
 
 
334 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  35.26 
 
 
337 aa  163  4e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  163  5e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  39.58 
 
 
337 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  39.93 
 
 
337 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  35.49 
 
 
331 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  36.55 
 
 
331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  38.14 
 
 
345 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  36.55 
 
 
331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  36.55 
 
 
331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  36.55 
 
 
331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  35.49 
 
 
331 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 
336 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  37.19 
 
 
334 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  36.55 
 
 
331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  35.49 
 
 
332 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  35.49 
 
 
332 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  35.49 
 
 
331 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  35.49 
 
 
331 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  35.49 
 
 
331 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  35.49 
 
 
331 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  35.49 
 
 
331 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  36.97 
 
 
339 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  35.74 
 
 
477 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  36.58 
 
 
347 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  35.79 
 
 
342 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  32.4 
 
 
326 aa  157  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  29.78 
 
 
349 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  30.68 
 
 
371 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  36.75 
 
 
346 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  38.91 
 
 
541 aa  148  1e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  32.75 
 
 
327 aa  148  1e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  32.78 
 
 
353 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  35.67 
 
 
377 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  46.07 
 
 
541 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  32.19 
 
 
281 aa  145  8e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  31.56 
 
 
281 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  33.65 
 
 
356 aa  141  2e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  33.93 
 
 
346 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  32.81 
 
 
345 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.09 
 
 
425 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  31.47 
 
 
355 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  32.24 
 
 
355 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  31.37 
 
 
351 aa  135  6e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  37.08 
 
 
357 aa  136  6e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  33.22 
 
 
350 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 
354 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  32.24 
 
 
355 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  32.24 
 
 
355 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  32.24 
 
 
355 aa  132  7e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  31.18 
 
 
391 aa  131  1e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  32.24 
 
 
355 aa  132  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  32.7 
 
 
355 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  32.7 
 
 
355 aa  130  2e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  32.7 
 
 
355 aa  131  2e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  32.7 
 
 
355 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  32.7 
 
 
355 aa  130  2e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  32.7 
 
 
355 aa  131  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  33.54 
 
 
355 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  31.18 
 
 
355 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 
505 aa  129  5e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  32.91 
 
 
382 aa  130  5e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  35.93 
 
 
375 aa  129  8e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  30.82 
 
 
357 aa  129  9e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  30.95 
 
 
398 aa  128  1e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  29.53 
 
 
517 aa  128  2e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>