More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2779 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  65.41 
 
 
188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  58.52 
 
 
191 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  61.05 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  58.72 
 
 
183 aa  197  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3014  MerR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
195 aa  121  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.37376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
181 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  30.95 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
398 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 
255 aa  67.8  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
343 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
343 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  37 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  38.71 
 
 
252 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 
135 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  37.61 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
258 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  45.05 
 
 
253 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
342 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
342 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  34.4 
 
 
159 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
342 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 
137 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
274 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  61.6  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  30.25 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
648 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  29.94 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 
153 aa  61.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  29.94 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
630 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
659 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  29.94 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  28.93 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
138 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 
254 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
630 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 
257 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 
140 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  36.07 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 
117 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
268 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
251 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
131 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
342 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
253 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
272 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  31.68 
 
 
253 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
150 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 
158 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
343 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 
157 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  35.43 
 
 
254 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 
251 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 
157 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
253 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
254 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
254 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
342 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
253 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  30.48 
 
 
253 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
254 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
253 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
254 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 
269 aa  57.8  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
343 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  30.19 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  40.78 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
135 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
392 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 
139 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
139 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>