191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2657 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  100 
 
 		 840 aa  1705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  54.44 
 
 		 1094 aa  798    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  46 
 
 		 625 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  46.92 
 
 		 647 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  43.02 
 
 		 706 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  43.78 
 
 		 631 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  41.86 
 
 		 687 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  40.26 
 
 		 677 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  39.68 
 
 		 698 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  40.6 
 
 		 676 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  32.33 
 
 		 708 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  35.72 
 
 		 620 aa  287  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  32.48 
 
 		 523 aa  240  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  28.81 
 
 		 625 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  29.14 
 
 		 661 aa  237  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  28.07 
 
 		 779 aa  234  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  28.74 
 
 		 779 aa  233  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  26.64 
 
 		 647 aa  200  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 		 734 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  30.41 
 
 		 872 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  27.55 
 
 		 798 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  27.96 
 
 		 798 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  30.78 
 
 		 799 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  26.4 
 
 		 643 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.13 
 
 		 536 aa  152  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  27.19 
 
 		 515 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  25.75 
 
 		 1363 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.98 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.21 
 
 		 569 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  26.2 
 
 		 1736 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  26.92 
 
 		 486 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  24.09 
 
 		 1272 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  31.56 
 
 		 1380 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 		 1363 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  30.38 
 
 		 1430 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  30.77 
 
 		 508 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  24.67 
 
 		 496 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  24.34 
 
 		 679 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.85 
 
 		 1201 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  27.66 
 
 		 1973 aa  100  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  27.86 
 
 		 1247 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  23 
 
 		 547 aa  95.1  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  24.67 
 
 		 506 aa  95.1  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  26.26 
 
 		 1303 aa  94.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.6 
 
 		 512 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  22.37 
 
 		 536 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  26.22 
 
 		 499 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  25.9 
 
 		 529 aa  92  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  25.9 
 
 		 529 aa  92  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  25.9 
 
 		 529 aa  92  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  25.9 
 
 		 516 aa  91.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  23.19 
 
 		 1248 aa  91.3  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  25.7 
 
 		 877 aa  90.9  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  25.71 
 
 		 516 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  25.71 
 
 		 516 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  25.71 
 
 		 516 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  25.71 
 
 		 516 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  25.71 
 
 		 516 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  25.4 
 
 		 524 aa  88.2  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  23.75 
 
 		 519 aa  86.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.04 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.04 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  26.04 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  26.04 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  25.89 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  36.69 
 
 		 628 aa  85.1  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  23 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  22.22 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  22.75 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  25.64 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  24.39 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  23.68 
 
 		 603 aa  78.2  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  22.92 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  21.74 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  25 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  25 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  26.99 
 
 		 1308 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  43.69 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  28.17 
 
 		 510 aa  73.9  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  22.55 
 
 		 1131 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  32.79 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  38.05 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  35.38 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.53 
 
 		 586 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.53 
 
 		 536 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.53 
 
 		 536 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  24.23 
 
 		 519 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.53 
 
 		 536 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  34.3 
 
 		 1299 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  33.72 
 
 		 1299 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  29.27 
 
 		 1601 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1131 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  31.44 
 
 		 1056 aa  67.8  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  23.9 
 
 		 760 aa  67.8  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 		 579 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  24 
 
 		 536 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  24 
 
 		 536 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  22.1 
 
 		 1131 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 		 591 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  25.71 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>