172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2635 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  283  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  66.15 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  44.44 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  41.98 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  45.24 
 
 
134 aa  124  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  44.09 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  38.76 
 
 
138 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  42.31 
 
 
133 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  42.31 
 
 
133 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  41.54 
 
 
133 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  36.51 
 
 
132 aa  100  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  36.92 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  39.53 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  34.59 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  39.68 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  38.17 
 
 
135 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  41.04 
 
 
138 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  35.66 
 
 
147 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  32.82 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  41.74 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  35.71 
 
 
152 aa  90.1  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  34.13 
 
 
152 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  40 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  39.13 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  41.27 
 
 
132 aa  84.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  37.69 
 
 
133 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  37.69 
 
 
133 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  36.09 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  35.38 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  35.88 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  32.85 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.62 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  32.54 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  32.12 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.6 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  34.35 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.33 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 
722 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.13 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  28.26 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  33.85 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.95 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  29.77 
 
 
360 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  32.33 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  28.47 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  29.55 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  33.81 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  25.19 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  33.81 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 
150 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  29.91 
 
 
131 aa  59.3  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  28.35 
 
 
519 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  34.03 
 
 
470 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  32.5 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1653  hemerythrin-like metal-binding protein  28.8 
 
 
143 aa  58.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000451029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  30.5 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  28.33 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  57.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  27.27 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  28.23 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
926 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  37.66 
 
 
498 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.77 
 
 
518 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  26.77 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
963 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 
249 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 
515 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 
515 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3649  hemerythrin-like, metal-binding  29.03 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16393  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  29.6 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  29.32 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  26.98 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.4 
 
 
779 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 
927 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 
579 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  26.92 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  27.82 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  30.43 
 
 
209 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  26.76 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  26.36 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>