More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2618 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
106 aa  209  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  83.96 
 
 
106 aa  180  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  71.96 
 
 
106 aa  153  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  72.64 
 
 
106 aa  143  8e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  74.42 
 
 
105 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  66.04 
 
 
107 aa  127  4e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  60.95 
 
 
107 aa  117  4e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  53.92 
 
 
103 aa  112  2e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  50.59 
 
 
110 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  50.59 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  48.08 
 
 
117 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  2.10725e-11  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  51.46 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  52.04 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.2041e-07  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40.95 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  44.66 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  43.27 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  51.28 
 
 
121 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  44.34 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 
108 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  51.14 
 
 
94 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  43 
 
 
109 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  49.48 
 
 
105 aa  90.9  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  45.78 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  45.92 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  44.95 
 
 
118 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  50.62 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  50.62 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  46.94 
 
 
118 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  46.25 
 
 
94 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  49.37 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  54.67 
 
 
112 aa  87  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  44.33 
 
 
108 aa  85.9  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  44.79 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  46.15 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  45.88 
 
 
93 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  45 
 
 
106 aa  84.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  44.74 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  44.94 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  2.20066e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  43.53 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.61 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  48.78 
 
 
113 aa  84.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
91 aa  84  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 
114 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 
108 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  42.57 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
93 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  39 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  43.59 
 
 
108 aa  82.8  1e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
90 aa  82.8  1e-15  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  41.03 
 
 
108 aa  82.8  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 
109 aa  82.4  2e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 
126 aa  82.4  2e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  46.99 
 
 
114 aa  82.8  2e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 
114 aa  82.4  2e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  44.58 
 
 
92 aa  82.4  2e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  42.27 
 
 
133 aa  81.6  3e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
110 aa  81.3  4e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
125 aa  81.3  4e-15  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  41.58 
 
 
118 aa  81.3  4e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  47.92 
 
 
112 aa  80.9  5e-15  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  37.74 
 
 
111 aa  80.9  5e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  39.6 
 
 
113 aa  80.9  5e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
102 aa  80.9  5e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 
144 aa  80.9  5e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  44.32 
 
 
102 aa  80.9  6e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 
104 aa  80.9  6e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  43.43 
 
 
110 aa  80.5  6e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  43.43 
 
 
110 aa  80.5  6e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  40.59 
 
 
133 aa  80.5  7e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  48.68 
 
 
106 aa  80.1  9e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  41.58 
 
 
110 aa  80.1  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  43.69 
 
 
116 aa  79.3  1e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.75528e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  41.76 
 
 
109 aa  79.7  1e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
109 aa  79.3  2e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  43.33 
 
 
168 aa  79  2e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>