More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2576 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  100 
 
 
287 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  68.82 
 
 
289 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  64.77 
 
 
289 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  55.8 
 
 
291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  55.43 
 
 
291 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  48.11 
 
 
283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  44.91 
 
 
455 aa  228  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  38.87 
 
 
286 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 
407 aa  209  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  37 
 
 
351 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 
412 aa  192  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 
291 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 
353 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  38.49 
 
 
352 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 
284 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  35.98 
 
 
373 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  33.6 
 
 
279 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  35.06 
 
 
284 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 
425 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
284 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 
378 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  35.42 
 
 
369 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  36.63 
 
 
280 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 
284 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
397 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
280 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  34.24 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  31.37 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  30.07 
 
 
280 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  33.21 
 
 
282 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  32.02 
 
 
281 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  32.44 
 
 
358 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
397 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.06 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29.88 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
297 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  31.6 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  29.88 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  29.75 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  31.47 
 
 
517 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
283 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.54 
 
 
297 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
283 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  29.36 
 
 
281 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.34 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  28.95 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  29.61 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 
285 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  32.55 
 
 
292 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  30.96 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  30.36 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
412 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  29.33 
 
 
284 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 
544 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 
290 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  26.97 
 
 
313 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
340 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 
297 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.46 
 
 
302 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.12 
 
 
279 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  28.68 
 
 
292 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  29.29 
 
 
718 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 
282 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
275 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  36.08 
 
 
275 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.85 
 
 
716 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
427 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  27.89 
 
 
456 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  30.23 
 
 
505 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  31.44 
 
 
650 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.43 
 
 
634 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.61 
 
 
302 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  31.06 
 
 
388 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.64 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  28.82 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  28.8 
 
 
283 aa  99  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.19 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.19 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.19 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.75 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.75 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.56 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.56 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>