More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2572 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2572  serine acetyltransferase  100 
 
 
225 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0870  Serine O-acetyltransferase  83.11 
 
 
225 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.504104  normal  0.0275303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2569  serine O-acetyltransferase  76.02 
 
 
222 aa  363  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000552654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  76.02 
 
 
222 aa  363  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  74.67 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  71.62 
 
 
233 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  72.02 
 
 
230 aa  331  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  63.59 
 
 
228 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  63.01 
 
 
261 aa  284  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  63.01 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  62.56 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  62.1 
 
 
261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  63.3 
 
 
259 aa  277  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  61.3 
 
 
258 aa  275  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  62.04 
 
 
258 aa  274  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  62.04 
 
 
258 aa  274  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1472  serine O-acetyltransferase  65.2 
 
 
230 aa  268  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  57.58 
 
 
258 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  63.64 
 
 
230 aa  266  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  62.25 
 
 
314 aa  266  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  59.72 
 
 
261 aa  265  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  57.14 
 
 
258 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1336  serine O-acetyltransferase  63.73 
 
 
230 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0260631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  59.09 
 
 
224 aa  262  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1236  serine O-acetyltransferase  57.52 
 
 
267 aa  261  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00306075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1936  serine O-acetyltransferase  59.83 
 
 
260 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0874161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1130  serine O-acetyltransferase  56.09 
 
 
269 aa  260  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  58.9 
 
 
223 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  55.61 
 
 
237 aa  258  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01353  serine acetyltransferase  53.22 
 
 
274 aa  257  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0083  serine O-acetyltransferase  58.37 
 
 
221 aa  256  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00127612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1662  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
261 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.317013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2686  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
261 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3151  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
261 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5217  serine O-acetyltransferase  57.66 
 
 
221 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000292465  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2165  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
261 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2551  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
261 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2602  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
261 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1438  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
261 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  54.87 
 
 
229 aa  255  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  60.19 
 
 
323 aa  255  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  57.85 
 
 
221 aa  254  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  58.47 
 
 
255 aa  254  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0109  serine O-acetyltransferase  57.21 
 
 
221 aa  254  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0088  serine O-acetyltransferase  56.76 
 
 
221 aa  254  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00228482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0088  serine O-acetyltransferase  56.76 
 
 
221 aa  254  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0085  serine O-acetyltransferase  56.76 
 
 
221 aa  254  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00846458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0084  serine O-acetyltransferase  56.76 
 
 
221 aa  254  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0119  serine O-acetyltransferase  56.76 
 
 
221 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000122226  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0088  serine O-acetyltransferase  56.76 
 
 
221 aa  254  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000145042  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5994  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
267 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0099  serine O-acetyltransferase  56.76 
 
 
221 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2083  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 
267 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  56.09 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1198  serine O-acetyltransferase  57.64 
 
 
280 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0792406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  51.67 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1397  Serine O-acetyltransferase  55.56 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11781  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  53.85 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  60.4 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1988  serine O-acetyltransferase  57.64 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.436626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2118  serine O-acetyltransferase  57.64 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5389  Serine O-acetyltransferase  57.21 
 
 
267 aa  252  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2102  serine O-acetyltransferase  58.52 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2029  Serine O-acetyltransferase  57.28 
 
 
254 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.057307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  52.28 
 
 
273 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  52.28 
 
 
273 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  52.77 
 
 
273 aa  250  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  52.28 
 
 
273 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1982  serine O-acetyltransferase  58.94 
 
 
320 aa  250  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  52.28 
 
 
273 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  52.79 
 
 
268 aa  250  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  52.77 
 
 
273 aa  250  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0083  serine O-acetyltransferase  55.86 
 
 
221 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  52.77 
 
 
273 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  52.77 
 
 
273 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0402  serine O-acetyltransferase  61.67 
 
 
229 aa  248  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000226719  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1505  serine O-acetyltransferase  57 
 
 
258 aa  248  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1223  serine O-acetyltransferase  57 
 
 
258 aa  248  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000216862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  52.77 
 
 
258 aa  247  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  52.34 
 
 
273 aa  247  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01650  nitrogen fixation serine O-acetyltransferase CysE1  56.94 
 
 
265 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  55.56 
 
 
256 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  56.16 
 
 
240 aa  246  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  55.22 
 
 
275 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  56.42 
 
 
259 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1080  serine O-acetyltransferase  56.7 
 
 
247 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0884216  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  56.48 
 
 
238 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  57.84 
 
 
240 aa  245  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  56.42 
 
 
253 aa  245  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2211  serine O-acetyltransferase  55.05 
 
 
327 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  55 
 
 
264 aa  244  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  55 
 
 
249 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  53.45 
 
 
250 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  53.88 
 
 
222 aa  243  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  55.56 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1395  serine O-acetyltransferase  54.32 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2311  serine O-acetyltransferase  55.95 
 
 
274 aa  242  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463939  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  54.71 
 
 
273 aa  242  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  54.08 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1117  Serine O-acetyltransferase  57.01 
 
 
247 aa  241  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>