More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2559 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  100 
 
 
513 aa  1023    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  80.55 
 
 
513 aa  824    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  70.81 
 
 
513 aa  736    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  62.48 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  62.13 
 
 
511 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  55.17 
 
 
519 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  37.4 
 
 
545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  37.4 
 
 
545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  38.43 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  35.85 
 
 
570 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  35.11 
 
 
544 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  36.58 
 
 
534 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  35.12 
 
 
550 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  33.72 
 
 
519 aa  277  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  33.4 
 
 
521 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  34.04 
 
 
519 aa  270  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  34.45 
 
 
521 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  33.73 
 
 
549 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  32.86 
 
 
519 aa  262  8.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  32.81 
 
 
519 aa  261  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  31.63 
 
 
527 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  33.71 
 
 
557 aa  253  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  32.09 
 
 
531 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  33.71 
 
 
550 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  33.93 
 
 
553 aa  250  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  30.12 
 
 
531 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  33.8 
 
 
501 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  34.65 
 
 
505 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  32.68 
 
 
532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  31.68 
 
 
531 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  35.06 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  32.93 
 
 
514 aa  244  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  31.88 
 
 
531 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  31.89 
 
 
502 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  32.81 
 
 
502 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  34.18 
 
 
500 aa  243  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  34.83 
 
 
500 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  31.91 
 
 
544 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  31.72 
 
 
544 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  33.47 
 
 
511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  30.18 
 
 
506 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  33.94 
 
 
545 aa  230  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  31.16 
 
 
505 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  31.47 
 
 
539 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  31.51 
 
 
507 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  32.18 
 
 
548 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  31.46 
 
 
523 aa  216  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  29.72 
 
 
497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  32.62 
 
 
520 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.2 
 
 
502 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.2 
 
 
502 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  30.73 
 
 
508 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  32.11 
 
 
497 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  31.28 
 
 
503 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  31.28 
 
 
503 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  29.82 
 
 
506 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  29.08 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  31.36 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  29.25 
 
 
501 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  30.42 
 
 
501 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  31.02 
 
 
500 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  31.02 
 
 
500 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  29.39 
 
 
482 aa  160  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  36.39 
 
 
310 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  25.72 
 
 
488 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  30.56 
 
 
500 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  29.44 
 
 
508 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  30.84 
 
 
491 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  28.63 
 
 
505 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0472  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 
311 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  28.78 
 
 
482 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  30.62 
 
 
301 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  28.29 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  27.42 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  29.91 
 
 
500 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  27 
 
 
501 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  28.21 
 
 
505 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  30.42 
 
 
500 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  29.87 
 
 
501 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  26.9 
 
 
511 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  30.66 
 
 
524 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  26.74 
 
 
508 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  30.2 
 
 
417 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  30.2 
 
 
526 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  26.03 
 
 
509 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  30.6 
 
 
526 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  37.79 
 
 
305 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  35.88 
 
 
307 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  31.09 
 
 
500 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.38 
 
 
494 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.38 
 
 
494 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  27.38 
 
 
494 aa  150  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.38 
 
 
494 aa  150  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.38 
 
 
494 aa  150  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  30.06 
 
 
491 aa  150  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.38 
 
 
494 aa  150  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  27.38 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.38 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  27.38 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  28.82 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>