34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2558 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  82.29 
 
 		 274 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  64.23 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  55.6 
 
 		 271 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  53.97 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  35.69 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  27.61 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1175  hypothetical protein  22.01 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  28.51 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  28.7 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  26.42 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  25.22 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  28.17 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  30.61 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  28.3 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  25.83 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  22.92 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  26.76 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  29.86 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  29.51 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  21.59 
 
 		 611 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  23.11 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  24.46 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  24.46 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  20.83 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  22.53 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  22.71 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  22.28 
 
 		 438 aa  55.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295961 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  20.93 
 
 		 515 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  22.56 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  23.33 
 
 		 254 aa  52.4  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  24.22 
 
 		 485 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  23.64 
 
 		 655 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>