More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2545 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  100 
 
 
191 aa  380  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  87.89 
 
 
192 aa  339  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  68.25 
 
 
194 aa  267  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  69.63 
 
 
193 aa  266  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  70.16 
 
 
193 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  63.44 
 
 
199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  58.06 
 
 
194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  59.57 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  50.8 
 
 
207 aa  175  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  51.6 
 
 
209 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  48.92 
 
 
213 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  49.2 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  53.26 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  51.4 
 
 
197 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  49.48 
 
 
198 aa  161  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  51.91 
 
 
194 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  48.66 
 
 
197 aa  160  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  50.81 
 
 
191 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  48.66 
 
 
197 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  48.13 
 
 
197 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  48.39 
 
 
193 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  51.06 
 
 
194 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  47.52 
 
 
205 aa  158  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  49.2 
 
 
197 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  50.79 
 
 
194 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  46.49 
 
 
186 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  48.13 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  48.13 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  48.13 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  48.13 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  48.13 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  47.8 
 
 
189 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  50 
 
 
201 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  50.53 
 
 
194 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  47.85 
 
 
200 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  48.66 
 
 
200 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  50.54 
 
 
197 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  47.59 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  48.11 
 
 
201 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  43.94 
 
 
201 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  43.85 
 
 
192 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  44.86 
 
 
193 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  51.37 
 
 
196 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  47.25 
 
 
197 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  43.92 
 
 
199 aa  151  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  51.06 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  47.85 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  46.49 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  48.91 
 
 
198 aa  150  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  42.7 
 
 
203 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  43.24 
 
 
191 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  46.88 
 
 
200 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  42.7 
 
 
191 aa  148  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  48.13 
 
 
198 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  43.24 
 
 
191 aa  148  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  47.34 
 
 
198 aa  148  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  46.35 
 
 
207 aa  148  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0693  maf protein  45.79 
 
 
200 aa  148  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  48.7 
 
 
194 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  47.45 
 
 
198 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  48.7 
 
 
194 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  42.7 
 
 
191 aa  147  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  42.7 
 
 
191 aa  147  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  47.28 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  43.48 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  47.28 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  47.28 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  44.68 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  46.52 
 
 
197 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  42.16 
 
 
191 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  47.15 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  47.37 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  46.52 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  46.99 
 
 
198 aa  144  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  48.15 
 
 
196 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  46.52 
 
 
197 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  46.52 
 
 
197 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  46.52 
 
 
197 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  44.21 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  45.74 
 
 
197 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  42.11 
 
 
191 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  42.39 
 
 
191 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  42.41 
 
 
202 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  41.3 
 
 
191 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  47.18 
 
 
198 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  48.19 
 
 
194 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  43.39 
 
 
192 aa  141  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  45.41 
 
 
203 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  48.66 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  43.48 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  45.9 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  46.81 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  40.74 
 
 
197 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  46.99 
 
 
196 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  44.62 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  44.62 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  46 
 
 
240 aa  137  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  43.24 
 
 
192 aa  137  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  43.85 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  46.49 
 
 
213 aa  137  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>