More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2544 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  80 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  67.84 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  66.09 
 
 		 230 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  65.22 
 
 		 230 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  67.84 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  66.67 
 
 		 228 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  62.56 
 
 		 228 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  51.98 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  51.77 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  53.3 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  55.11 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  44.4 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  47.19 
 
 		 235 aa  218  8.999999999999998e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  49.78 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44.74 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  45.58 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  47.6 
 
 		 246 aa  211  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  53.1 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  48.05 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  46.72 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  48.91 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  47.11 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  45.02 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  44.74 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  42.11 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  47.56 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  44.69 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  47.21 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  47.41 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  51.24 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  46.67 
 
 		 272 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  48.47 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  48.7 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  47.83 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  47.81 
 
 		 220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  52.4 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  44 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  44 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  49.36 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  46.55 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  46.4 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  48.76 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  48.47 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  48.03 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  48.03 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  46.93 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  46.4 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  45.13 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  46.46 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  45.85 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  42.06 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  41.67 
 
 		 275 aa  188  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  49.56 
 
 		 228 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  42.48 
 
 		 243 aa  187  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  42.17 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  41.05 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  46.29 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  42.27 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  47.81 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  45.61 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  45.85 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  47.5 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  45.26 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  47.37 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  46.05 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  46.15 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  43.97 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  47.37 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  46.15 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  47.14 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  45.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  45.96 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  44.23 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  42.17 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  45.45 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  43.04 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  45.73 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  46.49 
 
 		 229 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  45.73 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  45.73 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  44.64 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  45.61 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  43.87 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  45.18 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  45.78 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  42.17 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  44.78 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  44.4 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>