74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2532 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  36.57 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  37.07 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  34.35 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  30.3 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  34.78 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  36.21 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  32.46 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.58 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  32.76 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.62 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.66 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  30.6 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  29.31 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  29.31 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  29.31 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  29.31 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  32.48 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  31.9 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  31.9 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  30.83 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  34.44 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.36 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  31.54 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  29.2 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  30.28 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  29.82 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  30.17 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  31.36 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  29.37 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  25.36 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  28.15 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  27.05 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  26.32 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  29.25 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  25.53 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  29.7 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  25.19 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  26.15 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  31.97 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  30.83 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  30.83 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  28.12 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30 
 
 		 272 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  24.31 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  29.47 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  30.26 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  27.68 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  29.66 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  31 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  30.08 
 
 		 271 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  27.38 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.12 
 
 		 276 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  28.33 
 
 		 381 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  27.73 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  22.54 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  28.79 
 
 		 273 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  28.7 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  24.78 
 
 		 273 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  26.27 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  21.92 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  30.83 
 
 		 311 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  27.35 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  26.32 
 
 		 139 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>