42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2488 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  84.75 
 
 
364 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  70.47 
 
 
369 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  71.03 
 
 
369 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  59.15 
 
 
380 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  55.49 
 
 
372 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  56.23 
 
 
365 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  53.42 
 
 
420 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  52.14 
 
 
362 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  52.87 
 
 
363 aa  357  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  61.69 
 
 
431 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  38.95 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  39.22 
 
 
392 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  38.18 
 
 
415 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  38.18 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  38.18 
 
 
415 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  37.76 
 
 
415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  36.86 
 
 
417 aa  195  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  36.92 
 
 
410 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  38.89 
 
 
410 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  36.52 
 
 
409 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.14 
 
 
419 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  35.33 
 
 
407 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.81 
 
 
440 aa  186  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.44 
 
 
408 aa  182  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  34.19 
 
 
409 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.63 
 
 
429 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  37.32 
 
 
405 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106153  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  34.38 
 
 
409 aa  176  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.12 
 
 
705 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.12 
 
 
705 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  37.5 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  35.5 
 
 
412 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.31 
 
 
704 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  36.94 
 
 
411 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000543179  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  34.08 
 
 
705 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  33.24 
 
 
703 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  33.61 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  33.72 
 
 
703 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  32.14 
 
 
703 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  32.75 
 
 
411 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  30.64 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>