More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2476 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 566 aa  1172    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.46 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 681 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 		 637 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 685 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  39.52 
 
 		 603 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  35.84 
 
 		 909 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 362 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 714 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 878 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35 
 
 		 810 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1276 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.84 
 
 		 816 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  38.84 
 
 		 865 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.02 
 
 		 714 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 		 3145 aa  133  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3035 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 718 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  35.55 
 
 		 612 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 750 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 828 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 632 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 739 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.25 
 
 		 875 aa  126  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  34.18 
 
 		 622 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  37.81 
 
 		 833 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 		 828 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 1094 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.92 
 
 		 1694 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 4489 aa  124  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.64 
 
 		 764 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  34.56 
 
 		 864 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 1827 aa  120  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.42 
 
 		 725 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 620 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 697 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 3560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 833 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.19 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 828 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 280 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 578 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28.45 
 
 		 573 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 754 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.19 
 
 		 626 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 573 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  33.97 
 
 		 979 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 543 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 824 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.09 
 
 		 733 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 1737 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 		 2240 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.05 
 
 		 626 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  38.62 
 
 		 626 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.82 
 
 		 639 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  38.62 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  38.62 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  41.48 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 754 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 700 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 574 aa  104  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 		 614 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 1486 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 732 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 1005 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 602 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 646 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 611 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 662 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30.96 
 
 		 661 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  33.01 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.29 
 
 		 585 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 		 1034 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 635 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 635 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 227 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 3172 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 711 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 847 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.18 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.57 
 
 		 653 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 653 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 637 aa  99.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 601 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 636 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 3301 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 968 aa  97.8  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  33 
 
 		 577 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  37.67 
 
 		 437 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  31.72 
 
 		 314 aa  97.4  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  31.47 
 
 		 1154 aa  97.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>