More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2452 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
797 aa  1577    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  45.59 
 
 
805 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  45.07 
 
 
805 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  45.32 
 
 
805 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  45.19 
 
 
805 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  45.19 
 
 
805 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
797 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  53.32 
 
 
976 aa  811    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  65.5 
 
 
795 aa  973    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  45.69 
 
 
806 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  45.32 
 
 
805 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  83.19 
 
 
798 aa  1269    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  45.07 
 
 
805 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  43.61 
 
 
857 aa  642    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
837 aa  635    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.05 
 
 
803 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  45.71 
 
 
797 aa  662    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  46.2 
 
 
838 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  44.91 
 
 
798 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  45.69 
 
 
806 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
837 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  64.62 
 
 
795 aa  988    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
806 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  44.72 
 
 
815 aa  667    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
818 aa  650    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  75.53 
 
 
797 aa  1164    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.94 
 
 
836 aa  633  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  44.54 
 
 
798 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  44.54 
 
 
798 aa  631  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
885 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  43.09 
 
 
817 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
796 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 
894 aa  627  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  45.62 
 
 
836 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
743 aa  627  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
942 aa  623  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
849 aa  625  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.88 
 
 
794 aa  621  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.14 
 
 
821 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  45.23 
 
 
826 aa  620  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  43.68 
 
 
828 aa  615  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  45.83 
 
 
833 aa  616  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.07 
 
 
889 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  45.67 
 
 
827 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  42.51 
 
 
828 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.2 
 
 
889 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  42.16 
 
 
828 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  41.97 
 
 
954 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
887 aa  607  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  41.84 
 
 
826 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  43.54 
 
 
851 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
814 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  42.64 
 
 
753 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  44.28 
 
 
840 aa  602  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  43.01 
 
 
839 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
758 aa  602  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  45.02 
 
 
786 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
821 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  43.66 
 
 
799 aa  595  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  46.88 
 
 
724 aa  591  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  45.71 
 
 
752 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  45.15 
 
 
820 aa  592  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  42.34 
 
 
866 aa  590  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  43.65 
 
 
841 aa  591  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
852 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  42.75 
 
 
827 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  44.41 
 
 
759 aa  582  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  45.28 
 
 
838 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  41.26 
 
 
759 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  45.27 
 
 
790 aa  581  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
750 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  44.92 
 
 
801 aa  581  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  41.26 
 
 
759 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
861 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  40.81 
 
 
824 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  39.8 
 
 
802 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
827 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
835 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.28 
 
 
826 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  39.8 
 
 
802 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.42 
 
 
833 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
826 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  43.95 
 
 
817 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  43.27 
 
 
871 aa  575  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 
836 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 
836 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  42.73 
 
 
833 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 
747 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  45.6 
 
 
793 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
868 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  44.15 
 
 
816 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  44.66 
 
 
837 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
936 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  42.57 
 
 
834 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  40.66 
 
 
890 aa  560  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 
821 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  44.22 
 
 
794 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  38.32 
 
 
836 aa  559  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  42.8 
 
 
816 aa  560  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>