188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2441 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  88.71 
 
 		 248 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  89.11 
 
 		 248 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  88.71 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  86.69 
 
 		 248 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  86.69 
 
 		 248 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  84.27 
 
 		 248 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  87.5 
 
 		 248 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  82.26 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  82.66 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  83.06 
 
 		 248 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  81.45 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  81.45 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  80.24 
 
 		 248 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  84.27 
 
 		 254 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  77.42 
 
 		 248 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  74.6 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  74.6 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  80.65 
 
 		 248 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  74.6 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  78.23 
 
 		 248 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  72.58 
 
 		 541 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  72.18 
 
 		 541 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  72.18 
 
 		 541 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  71.77 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  71.77 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  67.74 
 
 		 248 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  47.76 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  36.95 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  33.87 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  32.13 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  31.17 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  29.25 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  28.94 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  30.59 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.99 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.62 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.67 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.43 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.61 
 
 		 420 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  37.04 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  46.27 
 
 		 398 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.48 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  35.59 
 
 		 394 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.36 
 
 		 283 aa  52.4  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 419 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 419 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1129  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  29.03 
 
 		 281 aa  52  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 344 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  32.76 
 
 		 394 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  30.08 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  38.1 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.48 
 
 		 417 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2709  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.25 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  35.53 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.71 
 
 		 418 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.28 
 
 		 420 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.83 
 
 		 416 aa  48.5  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.579832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  25.86 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.26 
 
 		 494 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.57 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.91 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  43.4 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.71 
 
 		 482 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.57 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  33 
 
 		 776 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.3 
 
 		 415 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.79 
 
 		 415 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  28.74 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.46 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  29.46 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  31.71 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.72 
 
 		 457 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  31.03 
 
 		 423 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36 
 
 		 424 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.6 
 
 		 396 aa  46.2  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.11 
 
 		 398 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  41.1 
 
 		 414 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.98 
 
 		 434 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  34.46 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 440 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3479  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.18 
 
 		 413 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.949619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>