More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2416 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  100 
 
 
166 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  62.05 
 
 
166 aa  214  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  44.79 
 
 
168 aa  130  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  45.27 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  39.74 
 
 
165 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  42.94 
 
 
165 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  39.49 
 
 
165 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  39.49 
 
 
165 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  38.36 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  38.36 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  40.27 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  40.97 
 
 
168 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  41.78 
 
 
159 aa  117  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  40.13 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  37.59 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.58 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  39.35 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.35 
 
 
164 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  36.88 
 
 
146 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  43.24 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  36.88 
 
 
146 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  38.36 
 
 
163 aa  111  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  46.72 
 
 
158 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  46.72 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  37.5 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  46.72 
 
 
158 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  39.42 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  36.49 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.14 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  38.51 
 
 
162 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  35.4 
 
 
164 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  36.49 
 
 
164 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  33.77 
 
 
168 aa  104  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  37.84 
 
 
166 aa  104  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  31.76 
 
 
150 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  37.84 
 
 
165 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.9 
 
 
160 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  37.84 
 
 
165 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  40.15 
 
 
147 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.71 
 
 
163 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  36.3 
 
 
164 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  38.67 
 
 
174 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  41.26 
 
 
189 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  38.03 
 
 
165 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  35.81 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  35.81 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  35.81 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  35.81 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  39.31 
 
 
163 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
164 aa  101  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  40.41 
 
 
161 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  35.62 
 
 
164 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  35.62 
 
 
164 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  35.62 
 
 
164 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  34.87 
 
 
518 aa  100  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  35.9 
 
 
174 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  38 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.73 
 
 
163 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  36.11 
 
 
167 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  35.57 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35.57 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  43.31 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35.57 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  35.57 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  35.57 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  32.1 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35.57 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  35 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  31.97 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  37.93 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.14 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  35.57 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  35.57 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.46 
 
 
167 aa  99  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  30.87 
 
 
150 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  33.33 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  34.19 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  34.29 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  38.04 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.12 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.14 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  33.54 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.17 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  36.17 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  39.31 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  39.31 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.86 
 
 
169 aa  97.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.18 
 
 
161 aa  97.4  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.5 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.9 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  32.52 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  34.93 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  34.76 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.17 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>