More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2406 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  76.04 
 
 		 314 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.94 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  43.12 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  43.12 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.89 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.54 
 
 		 317 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  44.48 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  42.68 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  44.13 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  45.29 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  43.37 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  45.4 
 
 		 330 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.25 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  45.98 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  45.98 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42.14 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.77 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.75 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.59 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.81 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  46.15 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  42.09 
 
 		 313 aa  231  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  44.94 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.96 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.94 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  44.97 
 
 		 314 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.74 
 
 		 334 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  44.27 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  40.77 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.12 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  40.85 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  37.69 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  40.83 
 
 		 335 aa  225  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  43.81 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.59 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  44.27 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.24 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  43.71 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  43.83 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  44.44 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  44.21 
 
 		 328 aa  221  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  44.13 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  41.69 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  38.07 
 
 		 370 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  42.63 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  39.68 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  43.49 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.19 
 
 		 334 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.09 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  40.32 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  42.62 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.68 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.08 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  44.95 
 
 		 340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  40.95 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  40.95 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  40.95 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  40.95 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  40.95 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  40.95 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  41.16 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  38 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  43.48 
 
 		 337 aa  215  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  40.19 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  43.63 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  40 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  40 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  40 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  42.38 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  40 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  40.38 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  42.63 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  39.7 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  37.89 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  39.68 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  43.12 
 
 		 302 aa  212  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  40.35 
 
 		 337 aa  212  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.21 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.96 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.88 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.69 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.51 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  40.51 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  43.52 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.92 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  38.3 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  41.72 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  44.51 
 
 		 319 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  40.19 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.41 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  40.24 
 
 		 331 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  38.36 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  37.46 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.01 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  39.44 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  39.13 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  39.41 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>