More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2368 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  100 
 
 		 381 aa  744    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  70.08 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  59.32 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  54.59 
 
 		 424 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  52.09 
 
 		 425 aa  368  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  55.64 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  47.53 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  40.48 
 
 		 422 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  42.29 
 
 		 431 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  36.75 
 
 		 429 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  37.21 
 
 		 428 aa  255  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  35.96 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  37.31 
 
 		 459 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  36.22 
 
 		 428 aa  235  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  42.56 
 
 		 437 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  36.81 
 
 		 429 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.67 
 
 		 466 aa  230  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.37 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  39.26 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  34.87 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.32 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  38.95 
 
 		 426 aa  222  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  38.68 
 
 		 447 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  41.16 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  38.61 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 		 424 aa  215  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  41.11 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  35.94 
 
 		 436 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  31.93 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  33.16 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  35.64 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  43.19 
 
 		 414 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 		 878 aa  209  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  34.14 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  33.69 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  35.4 
 
 		 439 aa  205  9e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  37.54 
 
 		 463 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  37.08 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  33.69 
 
 		 429 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  31.76 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  34.97 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.85 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  36.46 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  34.63 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.83 
 
 		 433 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.09 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.09 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  38.22 
 
 		 443 aa  202  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.09 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.09 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  38.76 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  34.55 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.83 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  30.31 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  44.64 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  36.91 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.57 
 
 		 433 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  32.74 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  35.13 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 		 438 aa  199  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.27 
 
 		 422 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  40.97 
 
 		 461 aa  199  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  38.22 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  37.08 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  41.75 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.93 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.04 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  38.18 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  38.18 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  38 
 
 		 468 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  37.11 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  41.1 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  39.16 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.31 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.47 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  39.15 
 
 		 461 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  36.24 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.19 
 
 		 421 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  35.79 
 
 		 421 aa  192  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  38.29 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.41 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  37.76 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.75 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  36.98 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  38.02 
 
 		 442 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  38.66 
 
 		 440 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  38.62 
 
 		 441 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.15 
 
 		 434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.15 
 
 		 434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  33.42 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  41.37 
 
 		 440 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  37.89 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>