41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2347 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  683    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  29.59 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  32.38 
 
 
239 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  26.27 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  25 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  26.72 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  25.07 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  24.07 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  27.75 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  23.16 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  22.6 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  25.36 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  27.78 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  22.62 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  22.92 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  24.44 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  23.56 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  24.52 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  28.04 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  23.35 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  21.32 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  23.45 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  25 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  21.65 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  20.43 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  21.82 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  23.65 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  25.56 
 
 
246 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  24 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  21.36 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5997  hypothetical protein  20.85 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  23.98 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  25.45 
 
 
329 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  22.22 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  22.42 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  22.42 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  22.42 
 
 
245 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  23 
 
 
244 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  21.97 
 
 
245 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  21.97 
 
 
245 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  21.97 
 
 
245 aa  42.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>