More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2317 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 588 aa  1160    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  39.86 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  38.85 
 
 		 602 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  38.58 
 
 		 596 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  39.58 
 
 		 623 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  38.81 
 
 		 622 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  42.67 
 
 		 627 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  37.83 
 
 		 597 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  39.3 
 
 		 598 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  37.69 
 
 		 596 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  38.04 
 
 		 596 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  37.35 
 
 		 596 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  36.38 
 
 		 592 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  34.37 
 
 		 613 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  36.99 
 
 		 592 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  36.21 
 
 		 592 aa  351  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  35.9 
 
 		 612 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  35.6 
 
 		 592 aa  348  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.81 
 
 		 609 aa  342  9e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  37.14 
 
 		 593 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  35.95 
 
 		 592 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  38.25 
 
 		 618 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  37.09 
 
 		 616 aa  335  9e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  36.61 
 
 		 591 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  33.05 
 
 		 592 aa  330  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.48 
 
 		 589 aa  329  7e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  39.3 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  35.95 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.92 
 
 		 624 aa  328  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  34.55 
 
 		 599 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 		 593 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  36.06 
 
 		 589 aa  320  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  37.1 
 
 		 599 aa  319  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  35.51 
 
 		 596 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  35.67 
 
 		 588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 		 607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  34.53 
 
 		 619 aa  310  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  33.83 
 
 		 613 aa  306  8.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  34.7 
 
 		 609 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  34.95 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  34.54 
 
 		 596 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  33.61 
 
 		 609 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.82 
 
 		 592 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 592 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  31.2 
 
 		 594 aa  297  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  33 
 
 		 632 aa  296  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  35.23 
 
 		 588 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.65 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  33.22 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  31.67 
 
 		 610 aa  290  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  31.28 
 
 		 610 aa  290  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  31.28 
 
 		 630 aa  289  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  33.06 
 
 		 609 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  31.28 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  32.44 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.11 
 
 		 610 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.72 
 
 		 588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.61 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  36.41 
 
 		 618 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 		 605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12848  trkA domain protein  35.55 
 
 		 469 aa  283  7.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  32.96 
 
 		 610 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  32.96 
 
 		 614 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.47 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  33.12 
 
 		 610 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  31.83 
 
 		 610 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  31.61 
 
 		 611 aa  281  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.83 
 
 		 601 aa  280  5e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.78 
 
 		 587 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  31.67 
 
 		 610 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  31.67 
 
 		 610 aa  280  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  31.67 
 
 		 610 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  31.67 
 
 		 610 aa  280  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  31.67 
 
 		 610 aa  280  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  31.22 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  31.67 
 
 		 610 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.4 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  32.52 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  30.9 
 
 		 641 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  32.18 
 
 		 608 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  32.18 
 
 		 608 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  31.28 
 
 		 619 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  32.18 
 
 		 608 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  33.5 
 
 		 593 aa  277  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  32.18 
 
 		 608 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  32.18 
 
 		 608 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  32.17 
 
 		 610 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  31.96 
 
 		 606 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.23 
 
 		 588 aa  276  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  31.51 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  33.51 
 
 		 574 aa  274  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  33.51 
 
 		 593 aa  273  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.28 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  31.88 
 
 		 609 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.43 
 
 		 583 aa  271  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  31.1 
 
 		 608 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  31.56 
 
 		 620 aa  269  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  32.12 
 
 		 603 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  31.98 
 
 		 610 aa  269  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>