More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2312 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  100 
 
 
590 aa  1163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  44.67 
 
 
572 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  42.91 
 
 
588 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  43.83 
 
 
558 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  43.49 
 
 
585 aa  400  1e-110  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  43.52 
 
 
585 aa  389  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  43.71 
 
 
591 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  43.11 
 
 
586 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  35.41 
 
 
574 aa  361  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  36.25 
 
 
571 aa  361  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  39.96 
 
 
578 aa  354  3e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  39.71 
 
 
588 aa  353  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  40.2 
 
 
605 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  39.16 
 
 
592 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  36.96 
 
 
574 aa  320  4e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  37.15 
 
 
583 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  38.49 
 
 
588 aa  310  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  35.66 
 
 
573 aa  308  2e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  36.78 
 
 
570 aa  290  7e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  39.44 
 
 
584 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  32.66 
 
 
569 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  32.66 
 
 
569 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  34.92 
 
 
597 aa  287  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  35.98 
 
 
584 aa  285  2e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  35.87 
 
 
570 aa  283  7e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  37.32 
 
 
571 aa  273  8e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  32.53 
 
 
711 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  1.3918e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  35.2 
 
 
571 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  36.51 
 
 
590 aa  267  3e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  34.67 
 
 
588 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  34.27 
 
 
579 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  37.94 
 
 
582 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  34.76 
 
 
575 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  34.43 
 
 
580 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  31.45 
 
 
626 aa  264  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  34.04 
 
 
583 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  34.29 
 
 
573 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
560 aa  256  1e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  33.03 
 
 
565 aa  254  2e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  32.92 
 
 
582 aa  251  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  32.21 
 
 
586 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  33.65 
 
 
570 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  29.96 
 
 
608 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  34.1 
 
 
570 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  33.27 
 
 
584 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  34.05 
 
 
596 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  33.9 
 
 
595 aa  241  3e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  33.53 
 
 
570 aa  241  3e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  34.52 
 
 
577 aa  241  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  31.41 
 
 
711 aa  240  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  29.86 
 
 
603 aa  239  7e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  34.67 
 
 
557 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  30.58 
 
 
730 aa  236  1e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  31.72 
 
 
568 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  29.8 
 
 
573 aa  234  4e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  31.73 
 
 
568 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  31.53 
 
 
568 aa  233  8e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  30.99 
 
 
581 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  33.03 
 
 
572 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  30.76 
 
 
578 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  31.44 
 
 
703 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.53 
 
 
576 aa  231  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  34.57 
 
 
556 aa  230  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  34.55 
 
 
576 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  31.51 
 
 
703 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  31.7 
 
 
574 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  30.77 
 
 
603 aa  229  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  33.05 
 
 
573 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  33.7 
 
 
576 aa  227  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  31.72 
 
 
620 aa  225  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  33.03 
 
 
590 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  31.84 
 
 
586 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  32.24 
 
 
575 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  32.07 
 
 
599 aa  221  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  30.13 
 
 
565 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  35.73 
 
 
563 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  33.97 
 
 
556 aa  219  9e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  32.97 
 
 
592 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  32.8 
 
 
605 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.92 
 
 
610 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.92 
 
 
610 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.92 
 
 
610 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.92 
 
 
610 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.92 
 
 
610 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  32.92 
 
 
610 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  34.95 
 
 
522 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  28.25 
 
 
580 aa  218  3e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.9535e-08  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  32.92 
 
 
610 aa  218  3e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  34.68 
 
 
551 aa  218  3e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  33.2 
 
 
574 aa  217  6e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  30.21 
 
 
729 aa  216  6e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  33.27 
 
 
556 aa  215  1e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  32.04 
 
 
585 aa  216  1e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  32.6 
 
 
569 aa  215  2e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  33.71 
 
 
570 aa  213  6e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  31.17 
 
 
573 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  33.2 
 
 
517 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  33.6 
 
 
521 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  1.10429e-09 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  33.46 
 
 
556 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  33.75 
 
 
522 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>