49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2311 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  100 
 
 		 185 aa  360  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  51.11 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  50.81 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  50.87 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  52.97 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.93 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.4 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.6 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.07 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.29 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  41.04 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  38.32 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  35.67 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  42.77 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 419 aa  91.3  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  36.84 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  37.67 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 647 aa  84.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  32.04 
 
 		 399 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.9 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.69 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  31.69 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  30.43 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  36.2 
 
 		 344 aa  67.8  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.76 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  35.97 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.68 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.45 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  30.22 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.6 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  28.9 
 
 		 344 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  33 
 
 		 137 aa  51.6  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.29 
 
 		 332 aa  51.2  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.81 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  27.72 
 
 		 371 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.45 
 
 		 354 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.18 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  29.91 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.77 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.97 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.88 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.09 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.24 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.17 
 
 		 345 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>