189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2310 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  100 
 
 		 173 aa  344  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.18 
 
 		 171 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.7 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.65 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.5 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.9 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.33 
 
 		 181 aa  140  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45 
 
 		 172 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  49.36 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.48 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.36 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.16 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.4 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  39.29 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.37 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.37 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  36.49 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.86 
 
 		 407 aa  68.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  32.39 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  32.72 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  41.11 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.29 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  31.95 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.97 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.16 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.74 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.97 
 
 		 462 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.48 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  31.25 
 
 		 359 aa  57.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.54 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.91 
 
 		 412 aa  57  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.92 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.68 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  30.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.96 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  30.2 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.96 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.2 
 
 		 334 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.41 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  29.03 
 
 		 375 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  40.91 
 
 		 343 aa  53.9  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  29.53 
 
 		 352 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.95 
 
 		 368 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  29.53 
 
 		 352 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.77 
 
 		 330 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  29.14 
 
 		 352 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  29.14 
 
 		 349 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.11 
 
 		 409 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.65 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  49.12 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  45 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  49.12 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  49.12 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.75 
 
 		 100 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  36.11 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.54 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.43 
 
 		 415 aa  52  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.9 
 
 		 407 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.14 
 
 		 352 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  29.11 
 
 		 403 aa  51.6  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.12 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  26.71 
 
 		 404 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  26.71 
 
 		 404 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  26.71 
 
 		 404 aa  51.6  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  50 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  50 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  50 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  50 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2895  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.19 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0682  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.65 
 
 		 190 aa  50.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.71 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  31.37 
 
 		 353 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.14 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  27.39 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.63 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  34.78 
 
 		 421 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  27.95 
 
 		 359 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  27.95 
 
 		 359 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  26.71 
 
 		 408 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  28.86 
 
 		 352 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  45.61 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  32.99 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.65 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.04 
 
 		 423 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  35.4 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  34.19 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.13 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 423 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.41 
 
 		 355 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.26 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.16 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.29 
 
 		 421 aa  48.5  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.6 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.37 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1499  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.38 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.85 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>