More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2307 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  82.38 
 
 		 210 aa  360  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  56.8 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  55.98 
 
 		 214 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  56.59 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  56.4 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  53.55 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  51.87 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  52.66 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  52.66 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  42.65 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  42.65 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  46.86 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  47.34 
 
 		 255 aa  185  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  47 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  46.41 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  48.1 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  47.29 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  46.53 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  48.26 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  44.29 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  47.92 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  46 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  43.84 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  43.27 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  46.01 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  45.54 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  42.79 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  45.24 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  43.14 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  43 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  42.23 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  43.56 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  42.25 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  42.51 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  43.9 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  44.28 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  44.28 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  42.93 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  41.71 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  39.11 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  43.07 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  43.56 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  42.35 
 
 		 242 aa  154  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.87 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  35.24 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  36.18 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  33.5 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  42.42 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  33.5 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  37.02 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  33.5 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.24 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.3 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  35.24 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  33.8 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  41.04 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  36.5 
 
 		 278 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  41.35 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  31.82 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.86 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  41.04 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  36.68 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 		 258 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  41.04 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  36.68 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  35.71 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  34.52 
 
 		 272 aa  141  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 255 aa  141  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  34.95 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  41.4 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  41.53 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  35.29 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  39.51 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  33 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  42.55 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  39.51 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  35.47 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  35.47 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  33.5 
 
 		 243 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  31.86 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  30.73 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  36.71 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  33.99 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  33.99 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  34.48 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  33.99 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  38.16 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  34.95 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  35.41 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  37.69 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  39.15 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  36.79 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  37.56 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  33 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>