More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2286 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  88.55 
 
 		 429 aa  782    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 428 aa  863    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  74.18 
 
 		 426 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  85.58 
 
 		 431 aa  735    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  87.38 
 
 		 429 aa  754    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  87.38 
 
 		 429 aa  754    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  81.54 
 
 		 428 aa  726    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  75.23 
 
 		 428 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  89.49 
 
 		 429 aa  770    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  76.05 
 
 		 430 aa  660    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  75.29 
 
 		 429 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  74.3 
 
 		 427 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  76.28 
 
 		 430 aa  663    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  85.51 
 
 		 429 aa  733    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  70.7 
 
 		 431 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  72.85 
 
 		 431 aa  625  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  70.7 
 
 		 431 aa  624  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  71.86 
 
 		 430 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  70.47 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  70.47 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  70.47 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  70.47 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  70.82 
 
 		 431 aa  614  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  70.82 
 
 		 431 aa  614  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  69.34 
 
 		 425 aa  616  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  70.93 
 
 		 431 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 427 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  71.03 
 
 		 428 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  70.93 
 
 		 431 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  70.23 
 
 		 429 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  70.7 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  70.7 
 
 		 431 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  70.99 
 
 		 425 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  69.39 
 
 		 427 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  69.16 
 
 		 427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 433 aa  599  1e-170  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  68.76 
 
 		 431 aa  600  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  72.37 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  67.99 
 
 		 427 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 428 aa  597  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 428 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  67.75 
 
 		 432 aa  596  1e-169  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  70 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  69.58 
 
 		 426 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 428 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  66.44 
 
 		 434 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  68.14 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 427 aa  594  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  69.25 
 
 		 433 aa  591  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  68.16 
 
 		 427 aa  591  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  69.56 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  68.46 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  66.51 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  67.99 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 428 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  67.06 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  67.84 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  67.52 
 
 		 426 aa  585  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  67.99 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 432 aa  586  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  67.99 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  67.99 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  69 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  68.52 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1452  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  64.43 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  65.36 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  65.6 
 
 		 437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>