More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2282 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  100 
 
 
250 aa  500  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  82.8 
 
 
284 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  80.99 
 
 
284 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  66.4 
 
 
287 aa  345  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  68.05 
 
 
287 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  65.15 
 
 
296 aa  334  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  62.5 
 
 
284 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  61.5 
 
 
285 aa  290  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  47.92 
 
 
276 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  49.38 
 
 
420 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  44.75 
 
 
439 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  45.41 
 
 
259 aa  207  9e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  43.75 
 
 
447 aa  208  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  46.44 
 
 
273 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  42.44 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  44.54 
 
 
421 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  39.43 
 
 
434 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  41.15 
 
 
435 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  43.46 
 
 
447 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  44.59 
 
 
285 aa  195  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  42.11 
 
 
442 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  43.95 
 
 
434 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  42.98 
 
 
490 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  40.16 
 
 
439 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  43.65 
 
 
452 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  41.63 
 
 
430 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  41.37 
 
 
464 aa  191  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  42.08 
 
 
432 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  42.13 
 
 
273 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  43.66 
 
 
425 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  40.43 
 
 
258 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  43.5 
 
 
432 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  42.08 
 
 
435 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  41.27 
 
 
461 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  38.78 
 
 
434 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  42.51 
 
 
483 aa  188  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  42.62 
 
 
436 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  42.62 
 
 
436 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  42.62 
 
 
436 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
275 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  40.56 
 
 
464 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  40.16 
 
 
433 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  41.37 
 
 
444 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
298 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  41.06 
 
 
311 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  41.63 
 
 
424 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  41.06 
 
 
311 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  41.49 
 
 
443 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.75 
 
 
465 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 
291 aa  184  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  39.17 
 
 
420 aa  184  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  41.87 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  40.59 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  40.42 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  42.21 
 
 
432 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  39.26 
 
 
283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  41 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  41.92 
 
 
298 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  41.6 
 
 
445 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  40.25 
 
 
309 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  41 
 
 
433 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  44.69 
 
 
537 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  40.34 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.04 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.65 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  39.92 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  39.04 
 
 
291 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 
293 aa  181  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  41.8 
 
 
435 aa  181  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  38.84 
 
 
279 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  38.65 
 
 
291 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  38.65 
 
 
291 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  38.65 
 
 
291 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  38.65 
 
 
291 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  41.46 
 
 
426 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.08 
 
 
295 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.65 
 
 
291 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.65 
 
 
291 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  40 
 
 
439 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  41.87 
 
 
430 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  39.33 
 
 
291 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  41.46 
 
 
371 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  41.08 
 
 
295 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.68 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  40.51 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.68 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.68 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.68 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.68 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.31 
 
 
292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.68 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  41.07 
 
 
434 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.68 
 
 
403 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  40.68 
 
 
439 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  39.59 
 
 
425 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  37.2 
 
 
311 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  41.42 
 
 
443 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  37.96 
 
 
289 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  40.25 
 
 
295 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>