More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2277 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  100 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  73.03 
 
 		 266 aa  401  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  66.19 
 
 		 278 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  66.05 
 
 		 269 aa  358  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  65.68 
 
 		 269 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  53.27 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  56.57 
 
 		 284 aa  298  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.17 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.33 
 
 		 223 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 476 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  35.29 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.33 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  49.11 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  32.64 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 183 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  49.11 
 
 		 181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.78 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.02 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.02 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  33.69 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.24 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 202 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  44.64 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  44.64 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  42.62 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  45.05 
 
 		 169 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  41.13 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  35.58 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  41.13 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  43.09 
 
 		 187 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  44.64 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 356 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  45.61 
 
 		 201 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  44.64 
 
 		 178 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 325 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  44.55 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  40.18 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 		 173 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  40.18 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.55 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  44.25 
 
 		 365 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  47.27 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 365 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  43.06 
 
 		 179 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  39.35 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  30.81 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 177 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  40 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  46.02 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 197 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 215 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>