117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2231 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  79.43 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  72.55 
 
 		 315 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  68.93 
 
 		 312 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  68.93 
 
 		 312 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  55.49 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  62.9 
 
 		 364 aa  374  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  55 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  56 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  56.45 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  52.71 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  51.29 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  52.33 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  54.77 
 
 		 293 aa  275  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  54.33 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  51.37 
 
 		 265 aa  271  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  51.5 
 
 		 291 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  53.12 
 
 		 275 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  55.38 
 
 		 275 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  54.03 
 
 		 410 aa  265  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  53.23 
 
 		 300 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  50.78 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  53.46 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  51.92 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  50.97 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  50.97 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  50.97 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  50.97 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  52.96 
 
 		 270 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  52.59 
 
 		 270 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  50.58 
 
 		 278 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  50.58 
 
 		 278 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  50.58 
 
 		 278 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  50.58 
 
 		 278 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  50.58 
 
 		 278 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  54.47 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  50.81 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  48.69 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  50.4 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  57.55 
 
 		 238 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  46.52 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  49.61 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  45.62 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  48.8 
 
 		 267 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  48.8 
 
 		 267 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  46.15 
 
 		 277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  55.4 
 
 		 228 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  41.55 
 
 		 558 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  40.76 
 
 		 487 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  49.4 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  44.32 
 
 		 284 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  46.15 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  53.77 
 
 		 219 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  45.24 
 
 		 508 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  37.6 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  41.05 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  42.28 
 
 		 646 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  45.22 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  43.92 
 
 		 517 aa  219  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  42.31 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  42.91 
 
 		 526 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  43.7 
 
 		 271 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  43.31 
 
 		 271 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  42.74 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  42.63 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  43.58 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  41 
 
 		 443 aa  198  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  42.74 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  47.03 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  39.04 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  40.55 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  43.03 
 
 		 284 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  40.55 
 
 		 277 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  38.8 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  42.15 
 
 		 520 aa  185  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  41.13 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  39.45 
 
 		 277 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4308  PSP1  38.29 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  38.67 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  38.52 
 
 		 514 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  37.6 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  39.04 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  38.49 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  37.25 
 
 		 508 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  38.66 
 
 		 404 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  39.34 
 
 		 398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  38.43 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  37.94 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  40.62 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  39.53 
 
 		 490 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0647  PSP1 domain protein  37.64 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  42.86 
 
 		 462 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  34.65 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1762  PSP1 domain-containing protein  36.64 
 
 		 259 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  37.01 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0402  PSP1 domain protein  36.76 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  37.55 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  45.88 
 
 		 456 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  38.39 
 
 		 463 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0231  PSP1  34.73 
 
 		 279 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>