259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2207 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  100 
 
 		 337 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  75.82 
 
 		 334 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  63.75 
 
 		 331 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  56.36 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  56.97 
 
 		 329 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  51.06 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  43.36 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  42.51 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  31.82 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  31.18 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  27.84 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  30.7 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.17 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  31.61 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  31.03 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  28.61 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  29.48 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  31.01 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  29.27 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  28.75 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.81 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  30.03 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  32.62 
 
 		 354 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.57 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  31.33 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  26.2 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  28.29 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  30.77 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  28.66 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  28.8 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.62 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  27.19 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  31.48 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  27.39 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  26.81 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  25.96 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  28.95 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  25.21 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  21.91 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  27.33 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  25.53 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.91 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.97 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  28.77 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.59 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  33.33 
 
 		 481 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  23.94 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  23.84 
 
 		 357 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  24.47 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.62 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.35 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  29.46 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  23.78 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  23.01 
 
 		 323 aa  87  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  22.52 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  25.29 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  26.98 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  21.47 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.87 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  19.33 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  28.88 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  28.88 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  23.01 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  26.33 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  23.91 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  22.45 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2928  DNA polymerase III subunit delta  25.83 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1844  DNA polymerase III subunit delta  25.83 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  26.48 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  26.43 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3017  DNA polymerase III subunit delta  25.83 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  27.91 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  28.7 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  21.05 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  27.63 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>