260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2158 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  100 
 
 		 313 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.63 
 
 		 307 aa  352  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  55.63 
 
 		 307 aa  352  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  48.84 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  47.35 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  47.52 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  41.21 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  41.05 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.95 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  39.06 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  32.4 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  34.93 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  30.87 
 
 		 328 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  32.03 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.15 
 
 		 373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.91 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.71 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.84 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.72 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.33 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.33 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  32.1 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.97 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  32.1 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  34.13 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  30.5 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.22 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.22 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.45 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.22 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.6 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.45 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.46 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  31.56 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.32 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.45 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.22 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.08 
 
 		 327 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  34.02 
 
 		 409 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  32.58 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  27.62 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.3 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.44 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.48 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.45 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.68 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.19 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  31.95 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.22 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.3 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.3 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.55 
 
 		 335 aa  99.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  33.98 
 
 		 263 aa  99  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  33.98 
 
 		 263 aa  99  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  32.55 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0394  cobalamin biosynthesis CobS-like protein  28 
 
 		 375 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313111  hitchhiker  0.00145489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.74 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  30.3 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  30.56 
 
 		 272 aa  96.3  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.62 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.56 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.9 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  28.62 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.41 
 
 		 267 aa  93.2  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  27.84 
 
 		 270 aa  92.4  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  30.04 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.41 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.71 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.29 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  31.25 
 
 		 277 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  29.96 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  28.63 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.43 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  30.59 
 
 		 265 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.17 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.88 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  28.06 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  28.42 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  26.88 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.28 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  30.51 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.23 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  28.46 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  27.27 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.33 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  32.37 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  26.81 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.37 
 
 		 267 aa  86.3  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  35.07 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.42 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  29.63 
 
 		 4917 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  31.73 
 
 		 4979 aa  85.9  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  29.01 
 
 		 4844 aa  85.9  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  32.52 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  28.84 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  32.52 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  27.44 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  31.22 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>