More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2105 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1398    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  50.52 
 
 		 676 aa  728    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  65.58 
 
 		 678 aa  953    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  47.99 
 
 		 678 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  47.64 
 
 		 679 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  46.28 
 
 		 676 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  44.36 
 
 		 694 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  44.87 
 
 		 687 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  44.64 
 
 		 686 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  41.74 
 
 		 684 aa  567  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  42.06 
 
 		 679 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  38.46 
 
 		 682 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  38.32 
 
 		 684 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  37.5 
 
 		 681 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  37.46 
 
 		 681 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  37.74 
 
 		 682 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  36.08 
 
 		 682 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  46.41 
 
 		 686 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  45.22 
 
 		 689 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  45.64 
 
 		 670 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  43.5 
 
 		 703 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  44.92 
 
 		 694 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  42.98 
 
 		 675 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  36.76 
 
 		 508 aa  249  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  34.78 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  33.05 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 		 470 aa  212  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  29.77 
 
 		 477 aa  196  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  28.84 
 
 		 473 aa  181  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  29.23 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  31.14 
 
 		 485 aa  164  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  30.92 
 
 		 807 aa  83.2  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  28.43 
 
 		 825 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  31.88 
 
 		 186 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  29.02 
 
 		 808 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  32.3 
 
 		 802 aa  78.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  29.61 
 
 		 812 aa  78.2  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 		 805 aa  78.2  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  29.61 
 
 		 812 aa  77.8  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  30.32 
 
 		 802 aa  77.8  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0376  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 776 aa  77.4  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  30.07 
 
 		 793 aa  77.4  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  28.89 
 
 		 799 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 		 805 aa  77  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  29.48 
 
 		 807 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  29.88 
 
 		 812 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  29.68 
 
 		 805 aa  76.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 799 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  28.9 
 
 		 806 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  29.63 
 
 		 803 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  28.9 
 
 		 806 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  27.62 
 
 		 804 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 		 806 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  28.76 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  28.77 
 
 		 804 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  31.29 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  27.98 
 
 		 806 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  27.98 
 
 		 806 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  29.01 
 
 		 805 aa  75.5  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  31.69 
 
 		 798 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  30.56 
 
 		 802 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  30.56 
 
 		 802 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  31.69 
 
 		 798 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  29.75 
 
 		 810 aa  75.1  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  28.87 
 
 		 818 aa  74.7  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 		 807 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  29.58 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  28.65 
 
 		 812 aa  74.7  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  31.16 
 
 		 805 aa  74.3  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  30.41 
 
 		 788 aa  74.7  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  30.07 
 
 		 784 aa  73.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 786 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.93 
 
 		 784 aa  73.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  31.76 
 
 		 779 aa  73.2  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  27.1 
 
 		 823 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  30.97 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 798 aa  73.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  30.56 
 
 		 802 aa  73.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  30.43 
 
 		 867 aa  73.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  28.87 
 
 		 804 aa  73.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  29.58 
 
 		 806 aa  72.8  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  29.86 
 
 		 802 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  30.28 
 
 		 799 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  25.7 
 
 		 807 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  29.68 
 
 		 821 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  30.32 
 
 		 783 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>