177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2099 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0619  response regulator receiver protein  62.01 
 
 		 234 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1495  putative PAS/PAC sensor protein  54.31 
 
 		 234 aa  278  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  38.79 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0028  CO metabolism transcriptional regulator RcoM2  26.8 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2142  CO metabolism transcriptional regulator RcoM  25.1 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.29 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.2 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.93 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.86 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  31.78 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11470  response regulator of the LytR/AlgR family  34.07 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5410  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.76 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5376  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000218123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5134  ABC transporter ATP-binding protein, C-terminus  40 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4967  ABC transporter ATP-binding protein  32.76 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4985  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000703532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  32.76 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.11 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  33.64 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.94 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  34.23 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.58 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.78 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.71 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.78 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  31.03 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.5 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  28.57 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  28.57 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.93 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  29.31 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  36.17 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  29.31 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  30.63 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 330 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0498  LytTR family two component transcriptional regulator  36.76 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  32.67 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  34 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.74 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.98 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.73 
 
 		 358 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  28.45 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  28.45 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  28.45 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  28.45 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  28.45 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.2 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  30.48 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  28.45 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  28.45 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.42 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  34.29 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  23.36 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  23.36 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.41 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  29.92 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  32.26 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  28.45 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  28.97 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1209  putative integral membrane sensor protein  28.32 
 
 		 368 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131047  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2098  putative integral membrane sensor protein  30.3 
 
 		 392 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.096975  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.55 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  28.32 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.77 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.3 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.64 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  25.23 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.47 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0891261 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>