282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2081 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 274 aa  543  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  77.86 
 
 		 273 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  65.69 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  60.22 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  62.45 
 
 		 274 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  57.58 
 
 		 272 aa  301  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  64.29 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  43.87 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  35.45 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  37.31 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  38.55 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  33.58 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  39.9 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  39.42 
 
 		 357 aa  142  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  35.04 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  35.04 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.57 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.78 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  34.35 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 		 359 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  31.27 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  34.98 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.37 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  29.92 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  35.42 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 304 aa  118  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 		 306 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  38.61 
 
 		 274 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  34.18 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  35.35 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  35.35 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  33.61 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  35.44 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  32.7 
 
 		 288 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  34.07 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  35.68 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  35.33 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  31.42 
 
 		 414 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  38.12 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.47 
 
 		 348 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  35.03 
 
 		 311 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  34.76 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  34.76 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 		 336 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  34.76 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  34.95 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  37.13 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  34.95 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 293 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 338 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  34.2 
 
 		 359 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  33.68 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  36.57 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  30.98 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  37.76 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  25.46 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  36.55 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  36.55 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 		 334 aa  99  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  37.93 
 
 		 249 aa  99  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28.27 
 
 		 326 aa  99  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  27.49 
 
 		 288 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  33.68 
 
 		 325 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 306 aa  98.6  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 407 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>