202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2073 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  100 
 
 		 1779 aa  3509    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  35.96 
 
 		 3244 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  35.74 
 
 		 2079 aa  705    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  34.93 
 
 		 3699 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.74 
 
 		 3699 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.6 
 
 		 3544 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  44.7 
 
 		 2636 aa  459  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  27.6 
 
 		 2402 aa  301  6e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  31.84 
 
 		 2820 aa  250  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.18 
 
 		 2853 aa  228  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.2 
 
 		 4231 aa  225  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  27.44 
 
 		 4465 aa  186  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.43 
 
 		 11716 aa  174  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  33.07 
 
 		 2522 aa  154  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  41.12 
 
 		 1830 aa  148  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  32.17 
 
 		 3474 aa  145  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  30.97 
 
 		 1631 aa  134  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  29.82 
 
 		 2656 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  29.38 
 
 		 1672 aa  131  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.5 
 
 		 1884 aa  128  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  32.13 
 
 		 2233 aa  126  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.67 
 
 		 3563 aa  126  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  47.93 
 
 		 672 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.46 
 
 		 2507 aa  113  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  31.54 
 
 		 2476 aa  108  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.8 
 
 		 1673 aa  107  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  24.88 
 
 		 2839 aa  107  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.93 
 
 		 887 aa  105  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  28.93 
 
 		 683 aa  104  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.11 
 
 		 994 aa  104  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  54.24 
 
 		 1275 aa  102  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  27.41 
 
 		 2890 aa  101  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.12 
 
 		 3598 aa  98.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  38.3 
 
 		 731 aa  96.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  28.32 
 
 		 2454 aa  96.3  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.39 
 
 		 2074 aa  96.3  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29 
 
 		 1867 aa  96.3  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26 
 
 		 1597 aa  95.5  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.61 
 
 		 3191 aa  94.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  44.2 
 
 		 1148 aa  92.8  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  44.69 
 
 		 788 aa  92  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.54 
 
 		 850 aa  87.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  47.76 
 
 		 494 aa  86.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  33.51 
 
 		 2001 aa  86.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  27.01 
 
 		 8321 aa  84.7  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  23.29 
 
 		 4848 aa  84  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  32.96 
 
 		 2503 aa  83.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1512 aa  84  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1124 aa  82  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.09 
 
 		 1092 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  28.49 
 
 		 1222 aa  81.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  25.77 
 
 		 5745 aa  80.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  33.82 
 
 		 2506 aa  80.5  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  56.32 
 
 		 622 aa  79.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  23.09 
 
 		 9867 aa  79.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  32.1 
 
 		 3911 aa  79  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  42.31 
 
 		 824 aa  79  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  49.59 
 
 		 884 aa  77.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  45.25 
 
 		 753 aa  77.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  29.41 
 
 		 1421 aa  76.3  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  43.88 
 
 		 2802 aa  75.5  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  29.36 
 
 		 1232 aa  75.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.07 
 
 		 2153 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  27.48 
 
 		 721 aa  74.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  36.1 
 
 		 2042 aa  73.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.75 
 
 		 962 aa  73.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  56.52 
 
 		 1439 aa  72.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  30.02 
 
 		 3477 aa  72.4  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.38 
 
 		 4978 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  36.67 
 
 		 2271 aa  70.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  36.67 
 
 		 2271 aa  70.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1879 aa  70.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.47 
 
 		 3089 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  35.15 
 
 		 1202 aa  69.7  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  25.69 
 
 		 2169 aa  69.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  33.73 
 
 		 840 aa  68.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  29.43 
 
 		 393 aa  68.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  25.76 
 
 		 3391 aa  67  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  37.14 
 
 		 1016 aa  66.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 815 aa  64.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.32 
 
 		 4798 aa  65.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  34.55 
 
 		 868 aa  65.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  36.97 
 
 		 1027 aa  65.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.81 
 
 		 674 aa  65.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  33.49 
 
 		 1869 aa  64.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  26.39 
 
 		 892 aa  64.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  30.65 
 
 		 2334 aa  64.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  28.15 
 
 		 2193 aa  63.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.54 
 
 		 3927 aa  63.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  34.42 
 
 		 635 aa  63.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.64 
 
 		 5020 aa  63.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1002 aa  63.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  36.31 
 
 		 867 aa  62.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  43.9 
 
 		 1338 aa  62.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  35.09 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.12 
 
 		 4220 aa  61.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  28.83 
 
 		 1011 aa  61.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 		 868 aa  60.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  38.04 
 
 		 868 aa  61.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 		 868 aa  61.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>