More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2064 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  100 
 
 
558 aa  1094    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  75.91 
 
 
554 aa  808    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  67.99 
 
 
553 aa  696    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  58.95 
 
 
553 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  56.47 
 
 
554 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  59.29 
 
 
553 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  56.76 
 
 
556 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  49.09 
 
 
560 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  44.01 
 
 
574 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  40.98 
 
 
577 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 
573 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  43.36 
 
 
572 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  43.96 
 
 
558 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 
566 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  41.68 
 
 
573 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  40.46 
 
 
579 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 
570 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  41.16 
 
 
583 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  41.16 
 
 
579 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  40.98 
 
 
579 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  40.98 
 
 
583 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  41.16 
 
 
579 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  40.98 
 
 
579 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  40.98 
 
 
579 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  41.12 
 
 
579 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  41.16 
 
 
579 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 
579 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  40.36 
 
 
565 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  38.37 
 
 
567 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  40.75 
 
 
565 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  40.53 
 
 
572 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 
559 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 
562 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  38.35 
 
 
559 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  38.35 
 
 
559 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  38.32 
 
 
605 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  37.36 
 
 
558 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  39.97 
 
 
586 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  40.31 
 
 
601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  43.35 
 
 
611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  43.94 
 
 
606 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  43.41 
 
 
606 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  43.74 
 
 
606 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  35.89 
 
 
562 aa  348  1e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 
555 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  36.48 
 
 
580 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 
552 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 
578 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 
556 aa  347  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  34.77 
 
 
565 aa  347  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.57 
 
 
554 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 
554 aa  347  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.69 
 
 
556 aa  347  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.68 
 
 
560 aa  346  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 
565 aa  346  6e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  37.52 
 
 
569 aa  346  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  36.04 
 
 
555 aa  345  8.999999999999999e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 
565 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  37.88 
 
 
559 aa  343  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  39.97 
 
 
589 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 
567 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  38.02 
 
 
554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 
557 aa  340  5e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  39.45 
 
 
599 aa  339  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.85 
 
 
552 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  36.76 
 
 
554 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  40.54 
 
 
558 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  34.3 
 
 
555 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  36.06 
 
 
574 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 
551 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  34.48 
 
 
555 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.93 
 
 
555 aa  335  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  39.16 
 
 
557 aa  334  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  35.51 
 
 
553 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 
567 aa  330  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  38.06 
 
 
557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  40.07 
 
 
576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 
556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.21 
 
 
559 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  35.83 
 
 
608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  39.46 
 
 
551 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  38.53 
 
 
558 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  34.41 
 
 
551 aa  327  5e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  38.24 
 
 
557 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  35.6 
 
 
553 aa  325  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 
555 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  38.8 
 
 
556 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 
558 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  36.35 
 
 
552 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  36.35 
 
 
553 aa  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  36.35 
 
 
553 aa  324  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  36.35 
 
 
552 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  36.35 
 
 
552 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.91 
 
 
588 aa  324  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 
568 aa  323  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  36.35 
 
 
553 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 
568 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  34.42 
 
 
553 aa  323  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  36.17 
 
 
553 aa  323  6e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>