273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2061 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  100 
 
 
149 aa  306  8e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  86.58 
 
 
150 aa  275  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  84.56 
 
 
150 aa  266  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  79.87 
 
 
149 aa  257  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  79.87 
 
 
149 aa  256  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  78 
 
 
150 aa  243  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  74.5 
 
 
149 aa  242  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  63.09 
 
 
149 aa  200  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0457  acetyltransferase  55.1 
 
 
158 aa  178  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  56.29 
 
 
172 aa  178  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.181413 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_399  acetyltransferase, GNAT family  54 
 
 
160 aa  177  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00235227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  54.05 
 
 
151 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0434  acetyltransferase  55.1 
 
 
158 aa  176  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000409483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2898  acetyltransferase  51.68 
 
 
151 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.230698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  54.36 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.509006  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0587  acetyltransferase  50 
 
 
159 aa  168  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2370  acetyltransferase  51.01 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3092  acetyltransferase  50.68 
 
 
150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0220833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0134  GCN5-related N-acetyltransferase  53.69 
 
 
152 aa  163  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490566  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  50.69 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0051  N-acetylglutamate synthase  52.35 
 
 
150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1142  acetyltransferase  52.38 
 
 
151 aa  159  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2113  acetyltransferase  52.67 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 
162 aa  153  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  48.67 
 
 
155 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  49.67 
 
 
155 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1546  acetyltransferase  50.67 
 
 
154 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00318584  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  46.21 
 
 
173 aa  141  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0861  acetyltransferase  48 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00507665  normal  0.131026 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0926  acetyltransferase  46.15 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.3472299999999997e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  46.15 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  46.15 
 
 
151 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  45.45 
 
 
151 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  46.15 
 
 
151 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  46.15 
 
 
151 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4451  acetyltransferase  45.45 
 
 
151 aa  129  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346737  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  45.45 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0884  acetyltransferase  44.76 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0173017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0741  acetyltransferase  44.76 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.296931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
182 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1075  acetyltransferase  41.61 
 
 
153 aa  120  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.353935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  40.94 
 
 
157 aa  120  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2308  acetyltransferase  41.22 
 
 
165 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
181 aa  120  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.905415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2061  acetyltransferase  39.87 
 
 
176 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0452  acetyltransferase  42.28 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  39.86 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0668  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2077  acetyltransferase  38.51 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5801  N-acetylglutamate synthase  41.61 
 
 
166 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.505653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
189 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1184  acetyltransferase  37.84 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0307  acetyltransferase  37.58 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2444  acetyltransferase  42.31 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  43.08 
 
 
189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  37.09 
 
 
191 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  39.19 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  37.16 
 
 
624 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  36.49 
 
 
624 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  38.52 
 
 
169 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4156  N-acetylglutamate synthase  39.31 
 
 
174 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0893  N-acetylglutamate synthase  38.67 
 
 
170 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.038377  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0836  N-acetylglutamate synthase  37.33 
 
 
170 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  38.93 
 
 
169 aa  103  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  39.86 
 
 
165 aa  103  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06840  N-acetylglutamate synthase  36.18 
 
 
176 aa  103  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  37.04 
 
 
169 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01560  N-acetylglutamate synthase  37.75 
 
 
171 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1870  acetyltransferase  36.24 
 
 
165 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1774  GCN5-related N-acetyltransferase  38.76 
 
 
168 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  37.58 
 
 
195 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  36.11 
 
 
645 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0489  N-acetylglutamate synthase  37.09 
 
 
174 aa  101  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114688  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0392  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
171 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
172 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0596  N-acetylglutamate synthase  35.07 
 
 
188 aa  99.4  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0558798  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  35.81 
 
 
624 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  35.81 
 
 
626 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2394  N-acetylglutamate synthase  34.62 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0108428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  35.38 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3360  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  34.11 
 
 
160 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  34.11 
 
 
160 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  34.11 
 
 
160 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4054  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
171 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.236772  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3287  N-acetylglutamate synthase  33.99 
 
 
184 aa  90.9  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0592405  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2806  N-acetylglutamate synthase  36.07 
 
 
173 aa  91.3  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000042501  hitchhiker  0.0000370361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12760  N-acetylglutamate synthase  36.64 
 
 
174 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246029  normal  0.121736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4141  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
167 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4989  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
212 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0562  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8374  N-acetylglutamate synthase  32.67 
 
 
172 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0382  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  34.65 
 
 
439 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0330  N-acetylglutamate synthase  34.65 
 
 
440 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000023217  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  36 
 
 
448 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  36 
 
 
448 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0871  N-acetylglutamate synthase  35.2 
 
 
448 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>