More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2022 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 150 aa  303  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  84.56 
 
 		 150 aa  262  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  74.31 
 
 		 144 aa  223  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  73.61 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  72.22 
 
 		 149 aa  214  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  72.22 
 
 		 149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.79 
 
 		 152 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 150 aa  183  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.11 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  57.72 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 147 aa  176  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 145 aa  176  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.38 
 
 		 184 aa  175  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.56 
 
 		 152 aa  175  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 159 aa  173  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  64.44 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  63.7 
 
 		 150 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.42 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 207 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  62.96 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 207 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  62.96 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  62.96 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.55 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.17 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 172 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.57 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.29 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  53.69 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 148 aa  159  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  61.76 
 
 		 156 aa  159  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  61.19 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  54.73 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  61.19 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.52 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 176 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 160 aa  156  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  62.96 
 
 		 150 aa  156  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 150 aa  156  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  56.2 
 
 		 146 aa  156  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 162 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  53.06 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  56.49 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 160 aa  153  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>