More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2013 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  100 
 
 		 472 aa  958    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  85.38 
 
 		 472 aa  837    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  77.07 
 
 		 472 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  75.64 
 
 		 474 aa  748    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  69.36 
 
 		 472 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  70.76 
 
 		 472 aa  697    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  75.64 
 
 		 474 aa  745    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  63.91 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  49.89 
 
 		 467 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.92 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  43.38 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  45.53 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  44.7 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  43.13 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  43.28 
 
 		 467 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.85 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  42 
 
 		 475 aa  362  8e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  42.27 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  40.34 
 
 		 488 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  40.38 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.49 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.53 
 
 		 469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  38.17 
 
 		 469 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  37.63 
 
 		 478 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  38.11 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.87 
 
 		 484 aa  315  9e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.29 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  39.45 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.74 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.31 
 
 		 469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  39.15 
 
 		 474 aa  299  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  36.15 
 
 		 474 aa  299  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  36.78 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.08 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  38.59 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.29 
 
 		 464 aa  290  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  37.65 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  34.96 
 
 		 501 aa  286  4e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  37.69 
 
 		 473 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  36.54 
 
 		 460 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  36.81 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  38.76 
 
 		 482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  37.42 
 
 		 460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  34.96 
 
 		 470 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  36.74 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  35.34 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.53 
 
 		 470 aa  280  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  35.68 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  34.11 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.11 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.1 
 
 		 470 aa  276  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.19 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  34.97 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  34.8 
 
 		 490 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.11 
 
 		 463 aa  269  8.999999999999999e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  35.93 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  34.11 
 
 		 733 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  34.24 
 
 		 460 aa  262  8.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  32.09 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.43 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  32.44 
 
 		 479 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  32.58 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.58 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.22 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  31.87 
 
 		 486 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  36.19 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  36.59 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  32.35 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.69 
 
 		 473 aa  247  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  33.82 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.72 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  31.69 
 
 		 484 aa  236  8e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.85 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  31.25 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.15 
 
 		 518 aa  226  5.0000000000000005e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  33.4 
 
 		 470 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  31.13 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  30.18 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  30.93 
 
 		 484 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  32.23 
 
 		 487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  30.8 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  33.9 
 
 		 465 aa  210  6e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.57 
 
 		 576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  34.29 
 
 		 551 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  33.27 
 
 		 549 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  30.65 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  32.39 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  30.45 
 
 		 548 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  31.64 
 
 		 547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  32.27 
 
 		 545 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  31.74 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  32.27 
 
 		 545 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  32.27 
 
 		 545 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1755  phosphoglucomutase  31.81 
 
 		 558 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  31.79 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  31.47 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  28.96 
 
 		 548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  30.28 
 
 		 549 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1265  alpha-phosphoglucomutase  31.24 
 
 		 578 aa  183  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  31.35 
 
 		 553 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>