19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1995 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  38.79 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  40.61 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1043  hypothetical protein  43.65 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0297225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  35.58 
 
 		 178 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  34.45 
 
 		 193 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  28.77 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  37.4 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  29.27 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  28.63 
 
 		 180 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  27.31 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  26.96 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  40.32 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  23.61 
 
 		 187 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3562  hypothetical protein  56.25 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0262  hypothetical protein  39.22 
 
 		 152 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3301  hypothetical protein  33.82 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2283  hypothetical protein  40.35 
 
 		 185 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>