More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1962 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 312 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.8 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 597 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 672 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 1035 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.73 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 379 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.19 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 344 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  32.29 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.83 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  34 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  28.83 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 544 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 581 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  29.92 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 727 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  28.2 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.42 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.16 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  27.86 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 847 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4526  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 746 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  31.78 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.76 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 261 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.34 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  31.47 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 704 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 347 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 235 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 276 aa  96.3  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.94 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.74 
 
 		 466 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>