More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1961 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
295 aa  610  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 
299 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
321 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
318 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
320 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 
330 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.85 
 
 
312 aa  158  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
310 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 
318 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 
302 aa  152  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
398 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.56 
 
 
321 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
316 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 
303 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
313 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
597 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
380 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
337 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
344 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 
305 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 
373 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
374 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
344 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
310 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
1035 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
294 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.49 
 
 
326 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
291 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.43 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
276 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 
310 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 
672 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
325 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.08 
 
 
326 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.29 
 
 
341 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
327 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.63 
 
 
326 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
326 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
323 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
292 aa  122  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
390 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
1177 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
1177 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
1250 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
246 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
289 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
317 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
1032 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
347 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
363 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
337 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
347 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
322 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
367 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  38.92 
 
 
233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.44 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
704 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30.77 
 
 
255 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
774 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
262 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
349 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
898 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
1032 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
898 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
350 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
264 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
390 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
277 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>