More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1922 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  809    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  64.74 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  54.4 
 
 		 389 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  45.6 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  46.2 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  47.01 
 
 		 382 aa  322  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  46.8 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  40.21 
 
 		 418 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  33.52 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  31.59 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  31.13 
 
 		 380 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  30.75 
 
 		 379 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  30.6 
 
 		 792 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  27.86 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  30.46 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.43 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  30.75 
 
 		 371 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  30.85 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  31.59 
 
 		 371 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.16 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.53 
 
 		 356 aa  136  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  32.06 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  27.67 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  27.81 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  25.2 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  26.67 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.83 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  25.79 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  26.18 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 		 1040 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25.37 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  26.77 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  25.71 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 391 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  25.83 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  28.03 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  27.04 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.14 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.03 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  25.48 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.26 
 
 		 389 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.13 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  26.21 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.95 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  25.49 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.42 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  29.21 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  23.64 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  26.96 
 
 		 442 aa  92.8  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  23.19 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  25.48 
 
 		 370 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  24.12 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.41 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  23.55 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  28.68 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.97 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  23.55 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  23.58 
 
 		 375 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  23.9 
 
 		 1061 aa  89.7  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 1153 aa  89.4  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  29.05 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>