More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1916 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
233 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1255  phosphatidate cytidylyltransferase  64.38 
 
 
262 aa  232  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00219294  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3728  phosphatidate cytidylyltransferase  64.06 
 
 
248 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  68.42 
 
 
255 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  67.84 
 
 
255 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  51.3 
 
 
258 aa  215  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  52.61 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  55.62 
 
 
236 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  44.69 
 
 
296 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
260 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  43.79 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 
267 aa  131  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.15 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40.57 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  43.83 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  39.15 
 
 
260 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  38.25 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 
265 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 
263 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 
263 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  38.53 
 
 
255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 
263 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  44.68 
 
 
262 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  47.69 
 
 
266 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  37.39 
 
 
264 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  45.03 
 
 
262 aa  121  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  47.73 
 
 
279 aa  121  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.49 
 
 
281 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 
271 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 
264 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  37.89 
 
 
278 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 
281 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  35.41 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  43.84 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  43.04 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  36.6 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  44.57 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  48.31 
 
 
259 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  33.61 
 
 
282 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  46.92 
 
 
275 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  38.8 
 
 
280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  37.18 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  44.87 
 
 
271 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  46.92 
 
 
269 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  48.12 
 
 
270 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  44.02 
 
 
277 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  35.98 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  34.5 
 
 
318 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.65 
 
 
475 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 
267 aa  111  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  41.9 
 
 
275 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  49.57 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  40.67 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 
264 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  39.07 
 
 
313 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
267 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
341 aa  109  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  49.14 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1424  phosphatidate cytidylyltransferase  50.75 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.521758  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 
284 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 
266 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 
273 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  47.13 
 
 
268 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 
285 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
261 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 
285 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  46.36 
 
 
310 aa  106  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  46.45 
 
 
276 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 
306 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  51.38 
 
 
268 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
298 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
298 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
298 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  43.17 
 
 
280 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  51.3 
 
 
276 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>