More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1912 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 553 aa  1117    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  86.62 
 
 		 553 aa  990    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1494  dihydroxy-acid dehydratase  83.73 
 
 		 553 aa  946    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  77.31 
 
 		 556 aa  875    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  90.96 
 
 		 553 aa  1036    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2747  dihydroxy-acid dehydratase  83.91 
 
 		 553 aa  947    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  89.15 
 
 		 553 aa  1014    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  86.26 
 
 		 553 aa  987    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  52.35 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  54.18 
 
 		 550 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  55.07 
 
 		 557 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  53.82 
 
 		 550 aa  598  1e-170  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 		 554 aa  598  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  54.18 
 
 		 550 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  53.82 
 
 		 550 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  53.45 
 
 		 550 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  53.25 
 
 		 553 aa  580  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 		 558 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  53.73 
 
 		 547 aa  581  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  54.51 
 
 		 548 aa  579  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  51.99 
 
 		 554 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  53.24 
 
 		 565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  53.04 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  54.28 
 
 		 547 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  52.34 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 		 566 aa  570  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  50.91 
 
 		 552 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  51.45 
 
 		 554 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  54.1 
 
 		 550 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  52.9 
 
 		 552 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  51.63 
 
 		 553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  52.52 
 
 		 565 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 558 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  50.91 
 
 		 555 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 		 565 aa  558  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  51.64 
 
 		 556 aa  558  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  53.19 
 
 		 547 aa  557  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 555 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 555 aa  552  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 569 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 559 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  48.4 
 
 		 561 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 554 aa  548  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 554 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  51.99 
 
 		 551 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  52.36 
 
 		 559 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  52.09 
 
 		 550 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 556 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 552 aa  544  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 558 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  51.26 
 
 		 565 aa  543  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 		 579 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 613 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 		 557 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 555 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 562 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 562 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  48.29 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 556 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  51.54 
 
 		 556 aa  535  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 562 aa  528  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  48.38 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  47.4 
 
 		 561 aa  528  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  48.19 
 
 		 552 aa  527  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 553 aa  521  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  46.49 
 
 		 580 aa  519  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  48.55 
 
 		 552 aa  520  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  46.98 
 
 		 577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  47.73 
 
 		 560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  46.43 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 560 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 		 561 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  51.53 
 
 		 575 aa  508  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  50.36 
 
 		 582 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  45.75 
 
 		 560 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 579 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 560 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 560 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  45.47 
 
 		 562 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  45.95 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  49.02 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  49.02 
 
 		 573 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  49.56 
 
 		 569 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>