More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1864 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  69.09 
 
 		 275 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  61.05 
 
 		 275 aa  331  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  57.66 
 
 		 275 aa  298  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  57.99 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  56.27 
 
 		 271 aa  288  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  54.72 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  41.39 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  45.09 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  41.61 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  38.97 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  44.81 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  47.57 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  44.07 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  46.1 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  44.7 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  43.98 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  40.81 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  42.01 
 
 		 293 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  40.74 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  39.7 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  36.73 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  43.4 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  43.18 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  43.59 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  43.59 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  43.18 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  41.44 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  43.28 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.18 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  42.49 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  43.13 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  44.02 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 		 291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  39.7 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  39.7 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  41.89 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  45.7 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  42.75 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  42.11 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  40.67 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  43.35 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  39.21 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  38.7 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 263 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  40.61 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>