More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1772 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  100 
 
 		 443 aa  898    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  77.3 
 
 		 444 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  84.23 
 
 		 443 aa  754    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  75.17 
 
 		 444 aa  667    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  74.5 
 
 		 444 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  73.3 
 
 		 452 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  70.07 
 
 		 455 aa  627  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  60.81 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  55.13 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  56.98 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  55.23 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  56.06 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  52.31 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  52.57 
 
 		 468 aa  421  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  54.29 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  54.07 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  51.01 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  50.62 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  49.66 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  49.43 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  48.84 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  47.7 
 
 		 422 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  50.5 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  51.64 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50.5 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  51.88 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  49.65 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  48.99 
 
 		 440 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  50.88 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  51.89 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  50.5 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  52.34 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  46.95 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  47.91 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  47.91 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  51.52 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  47.37 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  47.97 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  47.37 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.5 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  47.5 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  47.92 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  48.38 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  45.68 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  47.87 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  49.04 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  49.04 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  47.18 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  48.27 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  46.36 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  46.03 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  47.93 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  47.62 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  45.73 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  45.95 
 
 		 456 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  46.29 
 
 		 457 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  48.16 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  48.82 
 
 		 434 aa  362  8e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  49.25 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  47.19 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  45.84 
 
 		 456 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  47.21 
 
 		 471 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  45.75 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  46.28 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  45.66 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.9 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  47.3 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  45.19 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  45.19 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  46.62 
 
 		 444 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  43.65 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  46.44 
 
 		 478 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  47.8 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  47.55 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  44.74 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  47.8 
 
 		 440 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  46.75 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  49.72 
 
 		 410 aa  352  7e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  44.54 
 
 		 440 aa  352  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  45.23 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  45.99 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  44.23 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  46.05 
 
 		 481 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  46.02 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  45.82 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  44.62 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  46.02 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  45.63 
 
 		 449 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  45.54 
 
 		 478 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  45.54 
 
 		 478 aa  346  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.88 
 
 		 444 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  46.4 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  44.65 
 
 		 479 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  51.8 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>