More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1750 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  146  1e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.18565e-13  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  95.83 
 
 
72 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.11647e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 
72 aa  141  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 
72 aa  141  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 
72 aa  138  2e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 
72 aa  138  2e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  132  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
73 aa  127  4e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  1.64388e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  127  5e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.06677e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
75 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  127  7e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  126  9e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.28141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  81.94 
 
 
85 aa  126  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  126  1e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.98783e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  125  2e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.77018e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  2e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.19097e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.19555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.09815e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.8346e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.50239e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  7.69266e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.87625e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.23661e-11  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.60601e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.31634e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  122  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.71749e-08  hitchhiker  4.19913e-09 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  77.78 
 
 
72 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  1.8307e-05  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  79.17 
 
 
72 aa  120  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  120  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  120  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  79.17 
 
 
72 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  120  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  120  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  79.17 
 
 
72 aa  120  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  120  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  120  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.52368e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  119  1e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  119  1e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.04366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.47738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  1e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  118  2e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01127e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.8053e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.77082e-10  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.2982e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.35268e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.28096e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  118  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.90707e-07  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.40297e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  2e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.21348e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1167  translation initiation factor IF-1  80 
 
 
73 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  4.97253e-11 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
73 aa  117  4e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  80 
 
 
73 aa  117  4e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  77.78 
 
 
72 aa  117  4e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
73 aa  117  4e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  5e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.58057e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
73 aa  117  5e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  117  5e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.05996e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  117  5e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2765  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  5e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.219281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  5e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.07147e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  5e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  2.87842e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3900  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
153 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0744  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
75 aa  117  8e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6588  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
73 aa  117  8e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3674  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
111 aa  117  8e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  77.14 
 
 
116 aa  117  8e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.32232e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
75 aa  117  8e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>